Ministerstwo Finansów podtrzymuje stanowisko w sprawie programu „Cyfrowy Uczeń” na lata 2025-2029, co zostało potwierdzone w kolejnym piśmie Podsekretarz Stanu Hanny Majszczyk z 10 września 2025 roku do Sekretarza Stałego Komitetu Rady Ministrów. Resort finansów odnosi się do nowego tekstu OSR oraz odpowiedzi Ministra Edukacji z 9 września, jednak opinia z 8 września pozostaje aktualna w kwestii braku zasadności finansowania Centrum Informatycznego Edukacji na rozwój i utrzymanie bezpłatnego dziennika elektronicznego.
Ministerstwo Finansów argumentuje, że rozwój i utrzymanie systemów powinny następować po wdrożeniu projektu, a nie przed uchwaleniem odpowiednich przepisów ustawowych regulujących funkcjonowanie bezpłatnego dziennika elektronicznego. W związku z tym proponuje konkretne zmiany w § 3 pkt. 5 ust. 1 projektowanego rozporządzenia, sugerując modyfikację zapisu na „opracowanie koncepcji uruchomienia usługi” lub całkowite wykreślenie kontrowersyjnych fragmentów dotyczących rozwoju i utrzymania dziennika.